2023年9月,重点实验室成员李燕平副教授联合贵州师范大学张仁意副教授团队在SCI期刊《Fish and Shellfish Immunology》发表了题为《Comprehensive transcripts analysis based on single-molecule real-time sequencing and Illumina sequencing provides insights into the mining of Toll-like receptor family in Schizothorax lissolabiatus》的研究论文。贵州师范大学研究生段茜为论文第一作者,贵州师范大学张仁意副教授和我室固定研究人员李燕平为论文共同通讯作者。
研究内容简介:光唇裂腹鱼是我国西南地区重要的冷水鱼类,营养价值高,是生产地区的优质品种,为研究水生动物对特定环境的适应性提供了良好的模型。但是,在鱼类养殖过程中,容易感染传染病,如水霉病等,极大影响了裂腹鱼的养殖。本研究基于单分子实时测序和Illumina测序的综合转录本分析,试图挖掘免疫相关基因,以期为鱼类养殖、疾病防治提供分子基础。本研究构建了首个完整的光唇裂腹鱼转录组和全长转录组,进一步通过转录本数据挖掘,鉴定出16个Toll受体基因(slTLRs),其中8个slTLRs受到了正选择,且大部分正选择位点位于与病原微生物的识别相关的富含亮氨酸重复区(LRR结构域)。本研究通过对光唇裂腹鱼Toll样受体基因家族的分子进化的研究,初步从进化角度揭示了光唇裂腹鱼先天免疫基因与病原体的相关性,为该物种的疾病治疗和诊断提供理论基础。