2023年8月30日,刘乙博士以通讯作者在SCI期刊《The Journal of heredity》发表题为《Comparative analyses reveal potential genetic mechanisms for high-altitude adaptation of Schizopygopsis fishes based on chromosome-level genomes》的论文。
研究内容简介:裂腹科鱼类广泛分布于青藏高原及其邻近地区,是研究高海拔适应性的理想物种。本研究通过比较基因组学探讨了软刺裸裂尻鱼(Schizopygopsis malacanthus)和黄河裸裂尻鱼(Schizopygopsis pylzovi)的适应高海拔的潜在遗传机制。裂腹科鱼类基因组中许多扩展的基因家族与免疫应答相关,而许多收缩的基因家族在功能上与嗅觉相关。在HIF-1信号通路中angpt2a被检测受到正选择,可能与裂腹科鱼类的缺氧适应有关。另外的两个正选择基因cox15和ndufb10与产热过程相关,cox15存在一个裂腹科鱼类特异性错义突变(Gln115Glu),这可能有助于裂腹科鱼类的低温适应。此外,裂腹科鱼类的OR基因数量最少,OR基因收缩可能是由食物种类有限、低气压、低湿度、低温度等环境因素引起的。我们的研究将有助于扩大我们对Schizopygopsis应对高海拔条件的潜在适应机制的理解。