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重点实验室成员在《The Journal of heredity》期刊上发表论文

来源:长江上游鱼类资源保护与利用四川省重点实验室     作者:编辑:徐静    编辑:日期:2023-08-31    点击数:

 

2023830日,刘乙博士以通讯作者SCI期刊《The Journal of heredity》发表题为《Comparative analyses reveal potential genetic mechanisms for high-altitude adaptation of Schizopygopsis fishes based on chromosome-level genomes》的论文

研究内容简介:裂腹科鱼类广泛分布于青藏高原及其邻近地区,是研究高海拔适应性的理想物种。本研究通过比较基因组学探讨了软刺裸裂尻鱼(Schizopygopsis malacanthus和黄河裸裂尻鱼(Schizopygopsis pylzovi适应高海拔的潜在遗传机制。裂科鱼类基因组中许多扩展的基因家族与免疫应答相关,而许多收缩的基因家族在功能上与嗅觉相关。在HIF-1信号通路中angpt2a被检测受到正选择,可能与裂科鱼类的缺氧适应有关。另外的两个正选择基因cox15ndufb10产热过程相关cox15存在一个裂科鱼类特异性错义突变(Gln115Glu),这可能有助于裂科鱼类的低温适应。此外,科鱼类的OR基因数量最少,OR基因收缩可能是由食物种类有限低气压、低湿度、低温度等环境因素引起的。我们的研究将有助于扩大我们对Schizopygopsis应对高海拔条件的潜在适应机制的理解。