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重点实验室成员在《Scientific Data》发表研究论文

来源:长江上游鱼类资源保护与利用四川省重点实验室     作者:文正勇    编辑:徐静日期:2024-08-25    点击数:


2024824日,重点实验室成员文正勇、李锐、吕云云、李燕平在国际著名SCI期刊《Scientific Data》上发表一篇题为《Chromosome-level genome assemblies of vulnerable male and female elongate loach (Leptobotia elongata)》的研究论文。

研究内容简介:本研究利用MGIPacBio HiFiHi-C等高通量测序技术对长江上游特有珍稀保护鱼类长薄鳅的全基因组进行了测序,并通过生物信息学分析技术获得了长薄鳅雌雄性别染色体水平基因组遗传图谱各1个。长薄鳅雌性和雄性基因组大小分别为589 Mb586 Mb,其中98.61%98.22%Contig序列均可锚定到25条染色体上,表明获得了高质量的基因组图谱。此外,两个基因组中分别注释到25,25325,215个蛋白编码基因,其中98.8%97.4%的基因被注释为功能基因。比较基因组学结果显示,长薄鳅与斑马鱼、塔里木高原鳅以及贝氏高原鳅的基因组具有较好的遗传共线性,揭示本研究获得了高质量的长薄鳅遗传图谱。本研究获得的基因组数据将为长薄鳅的遗传资源保护和利用研究提供重要的遗传资源。

(撰稿:文正勇;初审一校:徐静;复审二校:覃川杰;终审三校:张楠)