2025年12月9日,重点实验室成员李燕平与贵州师范大学张仁意教授合作,在中国科学院SCI二区《Biology》上发表研究论文。论文题为《A Novel Mitochondrial Genome Resource for the Endemic Fish Gymnodiptychus integrigymnatus and Insights into the Phylogenetic Relationships of Schizothoracinae》。

研究内容简介:该研究首次对我国特有珍稀鱼类——全裸裸重唇鱼进行了完整的线粒体基因组解析,并对其在裂腹鱼亚科中的系统发育地位进行确定。全裸裸重唇鱼属于裂腹鱼亚科,体表几乎无鳞,生境脆弱,已被列为易危物种,具有重要的研究与保护价值。研究采用Illumina HiSeq X Ten高通量测序平台,成功获得了该物种完整的线粒体基因组序列。分析表明,其基因组全长16,714 bp,其结构与其他鱼类基本保守,但呈现出明显的A+T偏好性。值得注意的是,其tRNA-Ser (AGY) 缺乏典型的DHU臂结构,密码子使用也呈现明显的偏向性。在系统发育重建方面,研究整合了裂腹鱼亚科包括昆明裂腹鱼、全裸裸重唇鱼等在内的70余个物种的线粒体基因组数据,结合8个外群,基于13个蛋白编码基因构建了高置信度的系统发育树。结果显示:裂腹鱼亚科并非单系群,其中昆明裂腹鱼与重口裂腹鱼、齐口裂腹鱼和大理裂腹鱼形成一个支系;值得注意的是全裸裸重唇鱼并未与其同属物种聚类,而是与高度特化的裂腹鱼类群聚为一支。这一结果与传统的形态学分类存在冲突,提示全裸裸重唇鱼的形态特征可能是趋同演化的产物。该研究为深入探讨青藏高原鱼类的适应性演化、厘清裂腹鱼亚科复杂的系统发育关系提供了关键分子证据,对物种的准确鉴定、保护遗传学及后续进化研究具有重要科学价值。
(文/图:李燕平;初审一校:徐静;复审二校:覃川杰;终审三校:肖星星)